اندام های آلوده کننده در قارچ ها عبارتند از: کنیدی، زئوسپور، آسکوسپور. این اندام ها از نظر آسیب شناسی با هم متفاوت می باشند ولی در همه ی آنها به غیر از زئوسپور قارچ های آبزی نحوه ی تماس و نفوذ به بدن میزبان یکسان می باشد.
آلودگی قارچی در نتیجه ی تماس بین میزبان واجزای آلوده کننده مثل کنیدی آغاز می شود. کنیدی بیشتر قارچ های خشکی زی غیر متحرک بوده و به صورت تصادفی و به کمک عواملی مانند باد یا سایر نیروها با میزبان تماس حاصل کرده و پس از آن اولین قدم برای ایجاد آلودگی چسبیدنکنیدی به کوتیکول میزبان و تندشکنیدی است.
